手动天窗使用一段时间后会在滑轨、缝隙中沉积不少沙粒，若不定期清理会损伤天窗部件。一般手动天窗在使用2~3个月后，应把密封胶条或滑轨用纱布沾着清水清洗一下，擦干后可摸少许机油或黄油。平时或长时间停放前也可以用较细的滑石粉经常清洁，可增加密封圈的使用寿命。　　在冬季雪后或者洗车后，手动天窗玻璃与密封胶框有可能被冻住，这时若使用蛮力打开，容易导致手动天窗电机及橡胶密封条损坏。正确的做法是，将手动天窗打开，擦干边缘残留的水分。